福建省将加快“单一窗口”3.0建设，拓展企业覆盖面。利用“单一窗口”资源建设全省跨境电商综合服务平台。同时，全面推广“单一窗口”标准版，推动关港贸易一体化，并加强与周边区域的通关协作。    

在此目标下，福建在不断探索中形成了许多创新的做法。福建率先实现了进行出口货物申报报关报检无纸化“一单两报”，实现了关检联合对进出口货物一次申报、一次查验、一次放行的“三一个”模式。同时，也率先实现船舶进出口岸“一单四报”，即海关、检验检疫、海事、边检四个部门通过“单一窗口”办理船舶出入境业务，企业足不出户就可以向对应的口岸管理单位提交申报单及相关随附单据；并在全国首创检商“两证合一”，实施对外贸易经营者备案登记和原产地证企业备案。    

此外，福建还通过二维码扫描技术解决边检“梅沙”系统与互联网的物理隔离问题，在全国率先在互联网上开通了边检网上办证服务，一定程度上实现了边检非必要的执法作业前推至“单一窗口”，切实提高了口岸通关效率，边检办证不再需要跑现场。